RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 SNAPC3Q92966 411 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 LRFN5Q96NI6 719 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SYT4Q9H2B2 425 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GHITMQ9H3K2 345 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 NIPAL2Q9H841 368 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 CUTCQ9NTM9 273 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 CA14Q9ULX7 337 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 FRYLO94915 3013 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 TLCD2A6NGC4 264 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GMDSO60547 372 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 AKR7A3O95154 331 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 IL33O95760 270 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PNMTP11086 282 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 STOMP27105 288 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SDHAP31040 664 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 OR1D5P58170 312 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 PITPNAQ00169 270 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF117Q03924 483 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GKN2Q86XP6 184 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 NUDT9Q9BW91 350 aa6.85□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF576Q9H609 170 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 RCE1Q9Y256 329 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.84□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 MAS1P04201 325 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 HIST1H2ABP04908 130 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PRKCAP17252 672 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 RORAP35398 523 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PPICP45877 212 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ARL4DP49703 201 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PLA2G7Q13093 441 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 TNK1Q13470 666 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SYT13Q7L8C5 426 aa6.84□□□□□ -1.31
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ANKRD28-204ENST00000451422 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 MAP6Q96JE9 813 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 CITED4Q96RK1 184 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 AMELYQ99218 206 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 KLK11Q9UBX7 282 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-204ENST00000451422 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.84□□□□□ -1.31
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