RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTM3	P21266	225 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	NTF4	P34130	210 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	FHL1	Q13642	323 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	MELK	Q14680	651 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	CARD17	Q5XLA6	110 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	APH1A	Q96BI3	265 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	CIB1	Q99828	191 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIGM	Q9H3S5	423 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BN98	237 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT33A	O76009	404 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOX14	O95416	240 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPAN19	P0C672	248 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANPEP	P15144	967 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SELENOP	P49908	381 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	DAP	P51397	102 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	BID	P55957	195 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERVK-25	P63136	954 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	COX10	Q12887	443 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDSN	Q15517	529 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACKR1	Q16570	336 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	RFX4	Q33E94	735 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMD8	Q96LT4	415 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCF	Q9NPI8	374 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	UPB1	Q9UBR1	384 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDN14	O95500	239 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CGA	P01215	116 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD8B	P10966	210 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGA	P20933	346 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	EDNRA	P25101	427 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	POU1F1	P28069	291 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC6A6	P31641	620 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR3A2	P47893	321 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXYD6P3	P58550	94 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM45B	Q96B21	275 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT84	Q9NSB2	600 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS50	Q9UI38	385 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	MSTN	O14793	375 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC43A1	O75387	559 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD14	P08571	375 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF224	P0DH78	156 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOS3	P29474	1203 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACVR1B	P36896	505 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF18B	Q86Y91	864 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF566	Q969W8	418 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	EME1	Q96AY2	570 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2M2	Q96R28	347 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SELENBP1-208	ENST00000447402		A8MXE2	369 aa		12.11	□□□□□ -0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms