RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 OR8B8Q15620 311 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 UBE2FQ969M7 185 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 COPS3Q9UNS2 423 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PS29 197 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CHATP28329 748 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CD1CP29017 333 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SPRED1Q7Z699 444 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ASB16Q96NS5 453 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PPA2Q9H2U2 334 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PRRT4C9JH25 899 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SSX4O60224 188 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TPOP07202 933 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CD27P26842 260 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GDNFP39905 211 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 DLX5P56178 289 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TAS2R46P59540 309 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GPR85P60893 370 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 BATFQ16520 125 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SHEQ5VZ18 495 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 MISPQ8IVT2 679 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM82A0PJX8 343 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 P2RX6O15547 441 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CHRNB4P30926 498 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 RRADP55042 308 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GABREP78334 506 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SYT9Q86SS6 491 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 IGHEP01854 428 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF77Q15935 545 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PLK5Q496M5 336 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CST9LP1Q5W188 147 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 A0A0B4J2A0 478 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 POM121BA6NF01 834 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GMDSO60547 372 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 MED6O75586 246 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 EDDM3BP56851 147 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 BIN3Q9NQY0 253 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM11P17152 192 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 MC2RQ01718 297 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 RTL6Q6ICC9 239 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PBX4Q9BYU1 374 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1B0GX78 115 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GPRIN2O60269 458 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PRKACBP22694 351 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 MED17Q9NVC6 651 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 M0QYG6 137 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 Q499Y3 187 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 RAB39BQ96DA2 213 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 EMC6Q9BV81 110 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 LRIT2A6NDA9 550 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PMP2P02689 132 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 METRNLQ641Q3 311 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 Q6ZTK2 550 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms