RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMOQ9BU70 441 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUF2Q9BZD4 464 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1456Q9P272 454 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087X0M5 115 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GX30 115 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRB8 838 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BQF6 201 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNL4K9M1U5 179 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPB6O14558 160 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMC8O43402 210 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A17O43808 307 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCL13O43927 109 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FADS1O60427 444 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZIC3O60481 467 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTAG2O75638 210 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBR3O75828 277 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF13O75888 250 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP8O94778 261 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK2O95069 426 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX2-2O95096 273 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINE1P05121 402 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALOX5P09917 674 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDN2P20800 178 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL11P20809 199 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V1C1P21283 382 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ME2P23368 584 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMP3P35625 211 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASMTP46597 345 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC6A8P48029 635 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IST1P53990 364 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIO3P55073 304 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA20P61599 178 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HBA1P69905 142 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF117Q03924 483 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGCBQ16585 318 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf136Q5SQH8 315 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCST2Q5T1A1 773 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPTPQ5TA50 214 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA11Q86U17 422 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC20BQ86Y33 519 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CADM3Q8N126 398 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4C3Q8NH37 302 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF138Q8WVD3 245 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB8BQ92930 207 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORT1Q99523 831 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED18Q9BUE0 208 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED17Q9NVC6 651 aa3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms