RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A19Q695T7 634 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MISPQ8IVT2 679 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LAX1Q8IWV1 398 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T27Q8NH04 317 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HGDQ93099 445 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SIAEQ9HAT2 523 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCB9Q9NP78 766 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GNG8Q9UK08 70 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 COPS3Q9UNS2 423 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRG6 482 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BML4 177 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MASP2O00187 686 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 XKRYO14609 159 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UPK1BO75841 260 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RENP00797 406 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OPN1LWP04000 364 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UMODP07911 640 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TFPIP10646 304 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NAGAP17050 411 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKCAP17252 672 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACP1P24666 158 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SHC1P29353 583 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AVPR2P30518 371 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMB10P40306 273 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPAP49450 140 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PSPHP78330 225 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 BDH1Q02338 343 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR50Q13585 617 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PCOLCEQ15113 449 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MESTQ5EB52 335 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01590Q5TEZ4 76 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OTPQ5XKR4 325 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM198BQ6UWH4 519 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC190Q86UF4 302 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 POC5Q8NA72 575 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8K3Q8NH51 312 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF417Q8TAU3 575 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 THAP4Q8WY91 577 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GHSRQ92847 366 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL5BQ96KC2 179 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RASL10BQ96S79 203 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 COQ7Q99807 217 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT4Q9H2B2 425 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR54Q9H977 334 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CMAHPQ9Y471 501 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1CQ13936 2221 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPK0 400 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FLRT2O43155 660 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPP2O43688 288 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T1O43869 369 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NPIPB7O75200 414 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGA10O75578 1167 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPANK1O95872 356 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MT-ATP6P00846 226 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GP1BAP07359 652 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR3AP46098 478 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R43P59537 309 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms