RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 LRRC17Q8N6Y2 441 aa26.89■■□□□ 1.9
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CMTM4-202ENST00000394106 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CMTM4-202ENST00000394106 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CMTM4-202ENST00000394106 ALG2Q9H553 416 aa26.89■■□□□ 1.9
CMTM4-202ENST00000394106 CRLF2Q9HC73 371 aa26.89■■□□□ 1.9
CMTM4-202ENST00000394106 SLC35F4A4IF30 521 aa26.88■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa26.88■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 PHYHD1Q5SRE7 291 aa26.87■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 TUBA1AQ71U36 451 aa26.87■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa26.87■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 PFN4Q8NHR9 129 aa26.87■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 HIST1H2ACQ93077 130 aa26.87■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF229Q9UJW7 825 aa26.87■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 UGT2B15P54855 530 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 ATP5J2P56134 94 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 CAMK2DQ13557 499 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 NHLRC1Q6VVB1 395 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 VTCN1Q7Z7D3 282 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 WDFY1Q8IWB7 410 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 Q96MF0 132 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 NELFAQ9H3P2 528 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 DLL4Q9NR61 685 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 FAIMQ9NVQ4 179 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 TAS2R5Q9NYW4 299 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 E7EQL1 145 aa26.85■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 NDUFAB1O14561 156 aa26.85■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 IFNGR1P15260 489 aa26.85■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa26.85■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 ATP23Q9Y6H3 246 aa26.85■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa26.84■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 MT-ND1P03886 318 aa26.84■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 CDKN1AP38936 164 aa26.84■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 B3GLCTQ6Y288 498 aa26.84■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 USF3Q68DE3 2245 aa26.84■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 ASAH2BP0C7U1 165 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 THRBP10828 461 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 NCK1P16333 377 aa26.83■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 SLC35D2Q76EJ3 337 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 FAM162AQ96A26 154 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 SGTBQ96EQ0 304 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 LRR1Q96L50 414 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 PRRC1Q96M27 445 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 DHRS9Q9BPW9 319 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CMTM4-202ENST00000394106 C20orf141Q9NUB4 165 aa26.83■■□□□ 1.89
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CMTM4-202ENST00000394106 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
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CMTM4-202ENST00000394106 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa26.82■■□□□ 1.88
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CMTM4-202ENST00000394106 CD8AP01732 235 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 IFNW1P05000 195 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 FOSL1P15407 271 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 IFNA8P32881 189 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 FKBP9P1Q75LS8 142 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 HS6ST2Q96MM7 605 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 SLC38A2Q96QD8 506 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 ULBP2Q9BZM5 246 aa26.82■■□□□ 1.88
CMTM4-202ENST00000394106 SPAG4Q9NPE6 437 aa26.82■■□□□ 1.88
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