RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 HPDLQ96IR7 371 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC114Q96M63 670 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC7Q96M83 1385 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEFB118Q96PH6 123 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP2S1Q96SQ9 504 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CITED1Q99966 193 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC35A5Q9BS91 424 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHCHD7Q9BUK0 85 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF126Q9BV68 326 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF416Q9BWM5 594 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FTHL17Q9BXU8 183 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT23Q9C075 422 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEFB127Q9H1M4 99 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPH5Q9H2P9 285 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM206Q9H813 350 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TUBA4BQ9H853 241 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 VCPKMTQ9H867 229 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZWILCHQ9H900 591 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDR76Q9H967 626 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LPAR2Q9HBW0 351 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PALMDQ9NP74 551 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRPV5Q9NQA5 729 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 STARD5Q9NSY2 213 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMOXQ9NWM0 555 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHBDL2Q9NX52 303 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMOD2Q9NZR1 351 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP10DQ9P241 1426 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COPS7AQ9UBW8 275 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUN2Q9UH99 717 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBK1Q9UHD2 729 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CTNNA3Q9UI47 895 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF6Q9Y252 685 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHANK1Q9Y566 2161 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNX5Q9Y5X3 404 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CACNA1DQ01668 2161 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCN2AQ99250 2005 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEG1Q9ULI3 1381 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV39A0A0B4J263 110 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PNV4 684 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SDHAF1A6NFY7 115 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERICH4A6NGS2 130 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF716A6NP11 495 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEACAM18A8MTB9 384 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LEUTXA8MZ59 168 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CENPBD1B2RD01 187 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 WASH3PC4AMC7 463 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 E9PMD0 336 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 F8W036 122 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 H0YHG0 523 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C3orf84H3BNL1 204 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C15orf65H3BRN8 121 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGK494L7N484 410 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FCN1O00602 326 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KMOO15229 486 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTI1O43156 1089 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB14O43829 449 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLIN3O60664 434 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TPST2O60704 377 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CTAG2O75638 210 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 GATBO75879 557 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A5O76082 557 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFA7O95182 113 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OLFM2O95897 454 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LGI1O95970 557 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGLV2-23P01705 113 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAPN1P07384 714 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 H2BFMP0C1H6 154 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LYNX1P0DP58 116 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AREGP15514 252 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 GNSP15586 552 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAPN3P20807 821 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC2A5P22732 501 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AHCYP23526 432 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAX7P23759 505 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CXCR2P25025 360 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPIP34949 423 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms