RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM15Q9C019 465 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CR1P17927 2039 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WUJ7 227 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM64BA6NI03 449 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 M0R1B8 84 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TPST2O60704 377 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR5F1O95221 314 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 WNT11O96014 354 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IFNW1P05000 195 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF43P17038 809 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ITGA2P17301 1181 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PTNP21246 168 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CD40P25942 277 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CDKN1AP38936 164 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CDH12P55289 794 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN17P56750 224 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOWP63302 87 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IL1RL1Q01638 556 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR1Q1Q15612 314 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NPTX1Q15818 432 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FXNQ16595 210 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP7Q16829 419 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A25Q6T423 547 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KDM8Q8N371 416 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 WDR31Q8NA23 367 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR6S1Q8NH40 331 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TAMM41Q96BW9 452 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RADILQ96JH8 1075 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OXGR1Q96P68 337 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CDRT15Q96T59 188 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MCHR1Q99705 422 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGDIGQ99819 225 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SMR3AQ99954 134 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BDH2Q9BUT1 245 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RCE1Q9Y256 329 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CUBNO60494 3623 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OVOL3O00110 214 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GYG2O15488 501 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CHP2O43745 196 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC43A1O75387 559 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UPK3AO75631 287 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF432O94892 652 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF682O95780 498 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HPRP00739 348 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BGLAPP02818 100 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 T-ENOLP0DO92 83 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CBLP22681 906 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R41P59536 307 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PRPS1P60891 318 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ETFDHQ16134 617 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IFI44LQ53G44 452 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CBLL1Q75N03 491 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LINGO2Q7L985 606 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DTX2Q86UW9 622 aa6.7□□□□□ -1.34
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