RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MKXQ8IYA7 352 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MMP21Q8N119 569 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM104Q8NE00 496 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf30Q96M34 536 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SIGLEC6O43699 453 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ICMTO60725 284 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBP04435 133 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 STAG3L3P0CL85 134 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 AHCYP23526 432 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GNRHRP30968 328 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IDUAP35475 653 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL12P48061 93 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADPRHP54922 357 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GDF10P55107 478 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ACY1Q03154 408 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LTBQ06643 244 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MIDNQ504T8 468 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FGF14Q92915 247 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KIRREL1Q96J84 757 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CHODLQ9H9P2 273 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RAB18Q9NP72 206 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQ09 198 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FAM149AA5PLN7 773 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MT-CO1P00395 513 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A8P0DMV1 189 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 CCR6P51684 374 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TPPP2P59282 170 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 JAG1P78504 1218 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DNLZQ5SXM8 178 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 SEC11CQ9BY50 192 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RNF39Q9H2S5 420 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC31A1O15431 190 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CER1O95813 267 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR4E1P0C645 316 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A6P0DMU7 189 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A5P0DMU8 189 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A7P0DMV0 189 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR5H8P0DN80 308 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DOBP13765 273 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CNR2P34972 360 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 CST9Q5W186 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM198Q66K66 360 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CDH20Q9HBT6 801 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WUU8 490 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CD300LBA8K4G0 201 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARPC5O15511 151 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DAOP14920 347 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PMCHP20382 165 aa4.56□□□□□ -1.68
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