RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NRIP3Q9NQ35 241 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 MSTNO14793 375 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 SULT1B1O43704 296 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 IL1AP01583 271 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35E2P0CK97 266 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 CYB561P49447 251 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF546Q86UE3 836 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 SYT9Q86SS6 491 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 RETREG3Q86VR2 466 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRM-201ENST00000332175 CSO75390 466 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 TATDN3Q17R31 274 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-201ENST00000332175 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CAMK2BQ13554 666 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 OR6V1Q8N148 313 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF583Q96ND8 569 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 K7EPK0 472 aa20.64■□□□□ 0.89
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