RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SSR4P51571 173 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CAV3P56539 151 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CDONQ4KMG0 1287 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 DHRS13Q6UX07 377 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 SUMF1Q8NBK3 374 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 ZNF519Q8TB69 540 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 SNX33Q8WV41 574 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 DDIT4LQ96D03 193 aa16.12■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 COQ7Q99807 217 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PCSK5Q92824 1860 aa16.12■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 A0A0C4DFX4 3053 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQ72 361 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PLPP2O43688 288 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 GPANK1O95872 356 aa16.11■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 Q0VFX4 171 aa16.11■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 TAS2R43P59537 309 aa16.11■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.11■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 SYS1Q8N2H4 156 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 FADS6Q8N9I5 356 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.11■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 ABHD4Q8TB40 342 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.1■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.09■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRG6 482 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PRSS37A4D1T9 235 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 LIPT2A6NK58 231 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 AKR7A3O95154 331 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 IGHMP01871 453 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 GAAP10253 952 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 ZNF12P17014 697 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CD53P19397 219 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 F8A1P23610 371 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CAPZA2P47755 286 aa16.09■□□□□ 0.17
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