RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 CISD3P0C7P0 127 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SPI1P17947 270 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 AKR1D1P51857 326 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ST8SIA6P61647 398 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TNFRSF17Q02223 184 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 C4orf46Q504U0 113 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ELP2Q6IA86 826 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF425Q6IV72 752 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 BEST3Q8N1M1 668 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR2L3Q8NG85 312 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 HSPA12BQ96MM6 686 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LGR4Q9BXB1 951 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TM7SF3Q9NS93 570 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 RNF222A6NCQ9 220 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TTLL8A6PVC2 850 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GPR31O00270 319 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 PEX12O00623 359 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC5O15389 551 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LDB3O75112 727 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 UPK3AO75631 287 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GLCEO94923 617 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 STATHP02808 62 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 NGFRP08138 427 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GTF2F2P13984 249 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ELNP15502 786 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G5P39877 138 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 CCR2P41597 374 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ACTBP60709 375 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ACTG1P63261 375 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 CDK3Q00526 305 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC14Q08ET2 396 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNF77Q15935 545 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 LILRA6Q6PI73 481 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ENPP7Q6UWV6 458 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR4K14Q8NGD5 310 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR8K3Q8NH51 312 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GPX8Q8TED1 209 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A28Q96A46 364 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 EDEM2Q9BV94 578 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TRIM2Q9C040 744 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 CHST6Q9GZX3 395 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 EXO5Q9H790 373 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SYNPO2LQ9H987 977 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SFXN1Q9H9B4 322 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 VCANP13611 3396 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 NUMA1Q14980 2115 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR6C74A6NCV1 312 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 FAM25EA8MYX2 175 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 PRR32B1ATL7 298 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 BRINP1O60477 761 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ABHD16AO95870 558 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ADCYAP1P18509 176 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 MANEAQ5SRI9 462 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TMPRSS12Q86WS5 348 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SKA3Q8IX90 412 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 STOML3Q8TAV4 291 aa10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms