RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC6Q9BV81 110 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR35Q9HC97 309 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANSQ9NR45 359 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 A4GNTQ9UNA3 340 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35F4A4IF30 521 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf98E9PRG8 122 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINI2O75830 405 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF682O95780 498 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT-ND1P03886 318 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOD3P08294 240 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASAH2BP0C7U1 165 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 DANCRP0C864 163 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCK1P16333 377 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHCYP23526 432 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPS1P60891 318 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q5PR19 223 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD17Q5XLA6 110 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLL1Q75N03 491 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf196Q8IYI0 205 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR137CQ8N3F9 429 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM171Q8WVE6 324 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PERPQ96FX8 193 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSH2DQ96JZ2 352 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSX2Q9BZM3 304 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRLF2Q9HC73 371 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 OBP2BQ9NPH6 170 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R5Q9NYW4 299 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R3G1 203 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCC2O75069 709 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT11O96014 354 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA1P01009 418 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT4P22083 530 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTH2RP49190 550 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARF1P84077 181 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZP4Q12836 540 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM16Q2WEN9 425 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGGHGQ32M88 737 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD16Q6P6B7 361 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM239Q8WW34 195 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL8BQ9NVJ2 186 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT4BQ9UQ53 548 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMP3Q9UQV4 416 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX13Q9Y5W8 968 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A096LPE4 126 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPZ6 126 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP5K1CO60331 668 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7A10O76100 309 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6A2O95222 327 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF2P01344 180 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNW1P05000 195 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 UMPSP11172 480 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD99P14209 185 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNGR1P15260 489 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAX1P15863 534 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 YAP1P46937 504 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA1BP68363 451 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA4AP68366 448 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMK2DQ13557 499 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI44LQ53G44 452 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHEQ5VZ18 495 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GLCTQ6Y288 498 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA1AQ71U36 451 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OFCC1Q8IZS5 231 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM162AQ96A26 154 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGTBQ96EQ0 304 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RADILQ96JH8 1075 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRR1Q96L50 414 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLL4Q9NR61 685 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3KTA2 159 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FFAR1O14842 300 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCTN3O75935 186 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIDP55957 195 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST3GAL3Q11203 375 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A25Q6T423 547 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35D2Q76EJ3 337 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF148Q8N7C7 305 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS6ST2Q96MM7 605 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADA2Q9NZK5 511 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFL7Q9UHF1 273 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED31Q9Y3C7 131 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms