RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PRG6 482 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 POU2F1P14859 743 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FASP25445 335 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FHL1Q13642 323 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GK3PQ14409 553 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 IGFN1Q86VF2 1251 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 AQP11Q8NBQ7 271 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 OR10G2Q8NGC3 310 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 MCCC2Q9HCC0 563 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 RCE1Q9Y256 329 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35F4A4IF30 521 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 KLF4O43474 513 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ENTPD5O75356 428 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FCGR1AP12314 374 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FPR3P25089 353 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CD79BP40259 229 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 BIDP55957 195 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 PRPS1P60891 318 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FAM27E3Q08E93 113 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 MELKQ14680 651 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6AP1Q15904 470 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CARD17Q5XLA6 110 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FBXW9Q5XUX1 488 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 NHLRC1Q6VVB1 395 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GIPC3Q8TF64 312 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 LRTOMTQ8WZ04 291 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ELOVL5Q9NYP7 299 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 UPB1Q9UBR1 384 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF726A6NNF4 738 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 KRT33AO76009 404 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF432O94892 652 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GASTP01350 101 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 RPL4P36578 427 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN31Q12999 210 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TAF11Q15544 211 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TSPO2Q5TGU0 170 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZT83 130 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 AMIGO2Q86SJ2 522 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GABRG1Q8N1C3 465 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 OR2M2Q96R28 347 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 NTN4Q9HB63 628 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A10Q9NS82 523 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 MCIDASD6RGH6 385 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 PTP4A3O75365 173 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SLC43A1O75387 559 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 BCL10O95999 233 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ADAP00813 363 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GSSP48637 474 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGDIAP52565 204 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CTXN1P60606 82 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 LGALS3BPQ08380 585 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FAPQ12884 760 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK2DQ13557 499 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ACKR1Q16570 336 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP1Q6P2D0 407 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 HS3ST5Q8IZT8 346 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FANK1Q8TC84 345 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 BDH2Q9BUT1 245 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 NDEL1Q9GZM8 345 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ASB6Q9NWX5 421 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 IL20RAQ9UHF4 553 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 PKDREJQ9NTG1 2253 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFB2O95178 105 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 DAP3P51398 398 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCD3Q6STE5 483 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 KIF18BQ86Y91 864 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 WDFY1Q8IWB7 410 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC75AQ8NAA5 344 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 POMGNT2Q8NAT1 580 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 FEVQ99581 238 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 MALT1Q9UDY8 824 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 MGAT4BQ9UQ53 548 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C65A6NJZ3 312 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 UPK3AO75631 287 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 STAC2Q6ZMT1 411 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM123Q8N131 208 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 KATNB1Q9BVA0 655 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 TXNIPQ9H3M7 391 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf97H3BN30 126 aa19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms