RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SHISA3A0PJX4 238 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PLPP2O43688 288 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 IMPDH2P12268 514 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 ACTA2P62736 377 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 ACTG2P63267 376 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 IFITM3Q01628 133 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 Q0VFX4 171 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF519Q8TB69 540 aa20.51■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 MED18Q9BUE0 208 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.51■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 XKRYO14609 159 aa20.5■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 CAV3P56539 151 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 MLF1P58340 268 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R43P59537 309 aa20.5■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 SSPNQ14714 243 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 FADS6Q8N9I5 356 aa20.5■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 OR6S1Q8NH40 331 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 THAP4Q8WY91 577 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 TXNIPQ9H3M7 391 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.5■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 OPN1LWP04000 364 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SYS1Q8N2H4 156 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM156Q8N614 296 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD6Q96NE9 622 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.49■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 PRR32B1ATL7 298 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A18H0YCH9 400 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD9O00233 223 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 CASKO14936 926 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 MS4A18Q3C1V0 323 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 HES3Q5TGS1 186 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 F8A1P23610 371 aa20.48■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 RUNX1T1Q06455 604 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PUDPQ08623 228 aa20.48■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PROK2Q9HC23 129 aa20.48■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 PRSS37A4D1T9 235 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 G3V3Y1 287 aa20.48■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.47■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 WDR76Q9H967 626 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 HPF1Q9NWY4 346 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK5Q92824 1860 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.46■□□□□ 0.87
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