RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 C19orf84I3L1E1 186 aa20.18■□□□□ 0.82
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.18■□□□□ 0.82
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.18■□□□□ 0.82
SIGMAR1-201ENST00000277010 GIPC3Q8TF64 312 aa20.18■□□□□ 0.82
SIGMAR1-201ENST00000277010 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.18■□□□□ 0.82
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SIGMAR1-201ENST00000277010 OR52D1Q9H346 318 aa20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASB6Q9NWX5 421 aa20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 CACNA1CQ13936 2221 aa20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT33AO76009 404 aa20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-201ENST00000277010 RUNX1T1Q06455 604 aa20.13■□□□□ 0.81
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