RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.92□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 CD79BP40259 229 aa14.92□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 PITPNBP48739 271 aa14.92□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 HEXBP07686 556 aa14.9□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 CD14P08571 375 aa14.9□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 TAF13Q15543 124 aa14.9□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.9□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.9□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 TMEM234Q8WY98 164 aa14.9□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.9□□□□□ -0.02
CTCF-201ENST00000264010 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.9□□□□□ -0.02
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CTCF-201ENST00000264010 TACR3P29371 465 aa14.89□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 ALG12Q9BV10 488 aa14.89□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.89□□□□□ -0.03
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