RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260810.9

TOPBP1-201, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOPBP1, Length 5,378 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-201ENST00000260810 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.96□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 OR5J2Q8NH18 312 aa4.96□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.96□□□□□ -1.62
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TOPBP1-201ENST00000260810 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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TOPBP1-201ENST00000260810 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.95□□□□□ -1.62
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TOPBP1-201ENST00000260810 PGA3P0DJD8 388 aa4.95□□□□□ -1.62
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TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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TOPBP1-201ENST00000260810 NR2F6P10588 404 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 PTHLHP12272 177 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 LCN6P62502 163 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 DAB2P98082 770 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 TUBA3CQ13748 450 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 ZMYND11Q15326 602 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 CNPY1Q3B7I2 92 aa4.95□□□□□ -1.62
TOPBP1-201ENST00000260810 ALKBH6Q3KRA9 238 aa4.95□□□□□ -1.62
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