RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F4A4IF30 521 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 HTR3EA5X5Y0 456 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 GYG2O15488 501 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 RAD51DO75771 328 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 H1F0P07305 194 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 UMPSP11172 480 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 IL1RL1Q01638 556 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 LAPTM4AQ15012 233 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 SEC23BQ15437 767 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 WDR31Q8NA23 367 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MOSPD2Q8NHP6 518 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST6Q96QI5 342 aa19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR6C65A6NJZ3 312 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR5H1A6NKK0 313 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2ABP04908 130 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 IFNGR1P15260 489 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 AQP2P41181 271 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MTX3Q5HYI7 312 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TIMM23BQ5SRD1 257 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 WFDC8Q8IUA0 241 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 C20orf196Q8IYI0 205 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ANKK1Q8NFD2 765 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 NRGNQ92686 78 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2ACQ93077 130 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 LIME1Q9H400 295 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ROS1P08922 2347 aa19.57■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CADP27708 2225 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CDC42EP2O14613 210 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GSC2O15499 205 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 RNF13O43567 381 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SLC43A1O75387 559 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SERPINI2O75830 405 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR6A2O95222 327 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 FABP3P05413 133 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ITGA2P17301 1181 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA2P43356 314 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF730Q6ZMV8 503 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 P2RY8Q86VZ1 359 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 LRRC75AQ8NAA5 344 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 LRR1Q96L50 414 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SEPHS2Q99611 448 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HIF3AQ9Y2N7 669 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A15Q9Y619 301 aa19.56■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CIB4A0PJX0 185 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 F13BP05160 661 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 BIDP55957 195 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CAMK2DQ13557 499 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR52J3Q8NH60 311 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR6X1Q8NH79 312 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PIK3IP1Q96FE7 263 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 NELFAQ9H3P2 528 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GPR35Q9HC97 309 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.55■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PR80 420 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF587BE7ETH6 402 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OMPP47874 163 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 LIMS1P48059 325 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 RUNX1T1Q06455 604 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 STK11Q15831 433 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CARD17Q5XLA6 110 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR7E24Q6IFN5 339 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MCUR1Q96AQ8 359 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GPA33Q99795 319 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.54■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 SH3PXD2BA1X283 911 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GPR4P46093 362 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HMGA2P52926 109 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MELKQ14680 651 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PPA1Q15181 289 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 BEX5Q5H9J7 111 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 FGD3Q5JSP0 725 aa19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms