RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1029A2ATE0 324 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr173E9QAT7 321 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r40F6W043 852 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw9F8VPX2 458 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5152L7N200 190 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk5r2O35926 369 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf3P05524 245 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbr1P48758 277 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mnat1P51949 309 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erp29P57759 262 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlx4P70436 240 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrriq3Q14DL3 633 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgap1Q3UUQ7 922 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KizQ3UXL4 695 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm525Q3V3I5 90 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RilpQ5ND29 369 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21093Q6GQS8 569 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2j2Q6P073 259 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3aQ6P4P1 422 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1288Q7TQY0 312 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1087Q7TR63 313 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1028Q7TR89 324 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubash3bQ8BGG7 638 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh12Q8BYK4 316 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EndovQ8C9A2 338 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo4Q8CHQ0 385 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D2hgdhQ8CIM3 535 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Galnt18Q8K1B9 622 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RfesdQ8K2P6 157 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mmd2Q8R189 247 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1047Q8VGS0 319 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oasl1Q8VI94 511 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr2hQ923G2 150 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex13Q9D0K1 405 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Terb2Q9D494 218 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emc9Q9DB76 206 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps34Q9JIK9 218 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il22bQ9JJY8 179 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MvkQ9R008 395 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srd5a3Q9WUP4 330 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrknQ9WVS6 464 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xpr1Q9Z0U0 695 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf5Q9Z0Z7 446 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7145A0A087WS64 360 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1153A2AVC0 318 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A630073D07RikE9PWS6 100 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r16E9Q025 850 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C130060K24RikG3UWA8 416 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fmo6J3QMN6 532 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh16O88338 830 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrcP05480 541 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcpt1P11034 246 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P18524 117 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sar1aP36536 198 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp39Q02525 718 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Macrod2Q3UYG8 475 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm12253Q5NC48 229 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5431Q5NCB3 844 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata22Q5SV06 358 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clcn4Q61418 747 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1318Q7TQW6 320 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PcgF3Q8BTQ0 241 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ikzf5Q8BU00 419 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tab1Q8CF89 502 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35f6Q8VE96 372 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1317Q8VF84 316 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr170Q8VGL6 313 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr570Q8VH12 312 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oas1hQ8VI97 369 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrgpra6Q91ZC6 301 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubqln4Q99NB8 596 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naalad2Q9CZR2 740 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D3J9 298 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem41aQ9D8U2 264 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slamf1Q9QUM4 343 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec4eQ9R0Q8 214 aa9.86□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A1Y7VIU7 259 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp534A2A7A1 661 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phf11cB4XVP9 339 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930595D18RikD3Z642 64 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss32E9Q409 334 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3636E9Q5P1 227 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r61L7N2B8 865 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P04946 108 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Impdh2P24547 514 aa9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H3f3aP84244 136 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms