RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617185.4

TP53-222, Transcript of tumor protein p53, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53, Length 2,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53-222	ENST00000617185	NAE1	Q13564	534 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	IQCH	Q86VS3	1027 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	UBQLN3	Q9H347	655 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185		A0A1W2PR64	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185		A0A1W2PRV1	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	IL3	P08700	152 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	G0S2	P27469	103 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	VIPR2	P41587	438 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TOMM20	Q15388	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	THEM4	Q5T1C6	240 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GPA33	Q99795	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	PRO1933	Q9H354	126 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ACOT7	O00154	380 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GRM6	O15303	877 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	FGB	P02675	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TBXA2R	P21731	343 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	AKR1C3	P42330	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CAV2	P51636	162 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	IRF7	Q92985	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	LHX9	Q9NQ69	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185		A0A1W2PPH5	198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	APBB3	O95704	486 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CTSL	P07711	333 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CEBPB	P17676	345 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RPIA	P49247	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	ZNF234	Q14588	700 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TGIF1	Q15583	401 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CKAP5	Q14008	2032 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	IDS	B3KWA1	339 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	MFNG	O00587	321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	OR10H2	O60403	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	UGDH	O60701	494 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CD74	P04233	296 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CASR	P41180	1078 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	TAS2R43	P59537	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	CBFB	Q13951	182 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TP53-222	ENST00000617185	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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