RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 BET1O15155 118 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CBX7O95931 251 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 F3P13726 295 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 LIPAP38571 399 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 THBS3P49746 956 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MTCP1P56278 107 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 HHIPQ96QV1 700 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 NMNAT3Q96T66 252 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CLSTN3Q9BQT9 956 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PMP2P02689 132 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 IL2RGP31785 369 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 RTL10Q7L3V2 364 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MAP3K3Q99759 626 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 USP54Q70EL1 1684 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 E9PI62 339 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ELK1P19419 428 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 21.3
TNS1-220ENST00000611415 S100A11P31949 105 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CLDN17P56750 224 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 DEFA6Q01524 100 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 OR52N1Q8NH53 320 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TSSK2Q96PF2 358 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MS4A8Q9BY19 250 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 POFUT1Q9H488 388 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 35.3
TNS1-220ENST00000611415 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 GNB3P16520 340 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 FPR3P25089 353 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ACSM1Q08AH1 577 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 UHRF2Q96PU4 802 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 FKRPQ9H9S5 495 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 A0A087WUU8 490 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLC51BQ86UW2 128 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MISPQ8IVT2 679 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 HSD17B8Q92506 261 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PKMYT1Q99640 499 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CLEC2DQ9UHP7 191 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SYT5O00445 386 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 OMGP23515 440 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TMUB2Q71RG4 321 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TXN2Q99757 166 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TUSC2O75896 110 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PMS2P2O95744 297 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CD63P08962 238 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 BMP1P13497 986 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MAKP20794 623 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 GABRA2P47869 451 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CD276Q5ZPR3 534 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZTK2 550 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TMEM106AQ96A25 262 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CD207Q9UJ71 328 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CHD4Q14839 1912 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 A6NL46 340 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 P2RY10O00398 339 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 UTS2O95399 124 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 FUCA1P04066 466 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SRMP19623 302 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 CNR1P21554 472 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 AARDQ4LEZ3 155 aa11.07□□□□□ -0.64
TNS1-220ENST00000611415 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms