RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FHL1	Q13642	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC36A2	Q495M3	483 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZAR1	Q86SH2	424 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CARF	Q8N187	725 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PHF21A	Q96BD5	680 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	C3orf49	Q96BT1	292 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABHD1	Q96SE0	405 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GHITM	Q9H3K2	345 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	NANS	Q9NR45	359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		V9GY05	133 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A0A6YYJ9	748 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PAH	P00439	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGKV1D-16	P01601	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CT45A8	P0DMV1	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CT45A9	P0DMV2	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ATF1	P18846	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	SDHA	P31040	664 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	RORA	P35398	523 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FASLG	P48023	281 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCR9	P51686	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR10A3	P58181	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	EGR3	Q06889	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GRM7	Q14831	915 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR6V1	Q8N148	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	MED30	Q96HR3	178 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	DDO	Q99489	341 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	WASF3	Q9UPY6	502 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	IFITM5	A6NNB3	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF264	O43296	627 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT33A	O76009	404 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TF	P02787	698 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	GYPB	P06028	91 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGHV4-34	P06331	123 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	NGFR	P08138	427 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLU	P10909	449 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF24	P17028	368 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PTN	P21246	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	MPL	P40238	635 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAPZB	P47756	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPHA4	P54764	986 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLAUR	Q03405	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	MADCAM1	Q13477	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	FZD2	Q14332	565 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q499Y3	187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CEP78	Q5JTW2	689 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	LEG1	Q6P5S2	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q6ZS52	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	SIAH3	Q8IW03	269 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-223	ENST00000588516	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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