RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 NR2F1P10589 423 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 MYL2P10916 166 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CDH1P12830 882 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 NPPBP16860 134 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ADRA2CP18825 462 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 HK1P19367 917 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 IMPDH1P20839 514 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SAT1P21673 171 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CCNOP22674 350 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 AHCYP23526 432 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GIFP27352 417 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GCAP28676 217 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CD1BP29016 333 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 IL12AP29459 219 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CRABP1P29762 137 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CD40LGP29965 261 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 PRDX6P30041 224 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SRD5A2P31213 254 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GPC1P35052 558 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 PTPN7P35236 360 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CRATP43155 626 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ALDH3B2P48448 385 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SERPINB10P48595 397 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SLC1A6P48664 564 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 MARCKSL1P49006 195 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 VEGFCP49767 419 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 P2RY4P51582 365 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RAB38P57729 211 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 OR2B6P58173 313 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DEFA1P59665 94 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DEFA3P59666 94 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SELENOVP59797 346 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DYNLT1P63172 113 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ID2Q02363 134 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 LIPEQ05469 1076 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SLC3A1Q07837 685 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CDH17Q12864 832 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 MERTKQ12866 999 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CHIT1Q13231 466 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CCNIQ14094 377 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SERTAD2Q14140 314 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 HNF4GQ14541 408 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 PRPSAP1Q14558 356 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RPS6KA2Q15349 733 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 TRIP10Q15642 601 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SGCBQ16585 318 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 TUSC1Q2TAM9 212 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 MST1LQ2TV78 715 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RNF212Q495C1 297 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CDKL4Q5MAI5 379 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DDI2Q5TDH0 399 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SAMD5Q5TGI4 173 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC38Q5VT99 294 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GPR107Q5VW38 600 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF544Q6NX49 715 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 AADACL2Q6P093 401 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF549Q6P9A3 640 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 FKBP9P1Q75LS8 142 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SPATC1Q76KD6 591 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 RRM2BQ7LG56 351 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 SZRD1Q7Z422 152 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 DHDDSQ86SQ9 333 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM17Q86X19 198 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 THNSL2Q86YJ6 484 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 CPNE8Q86YQ8 564 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ARMC8Q8IUR7 673 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 C9orf40Q8IXQ3 194 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 PPIL6Q8IXY8 311 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ADGRG5Q8IZF4 528 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 C4orf33Q8N1A6 199 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF786Q8N393 782 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 METTL4Q8N3J2 472 aa2.12□□□□□ -2.07
SNORD53-201ENST00000579969 GALNT4Q8N4A0 578 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms