RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FAM227AF5H4B4 570 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 EPHB6O15197 1021 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 IRF2P14316 349 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FABP4P15090 132 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 RAB41Q5JT25 222 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 DCUN1D4Q92564 292 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PN81 502 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TLCD2A6NGC4 264 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CD8B2A6NJW9 211 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF14O43557 240 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT2O60909 372 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 IFNW1P05000 195 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA7P36544 502 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 HSF1Q00613 529 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CD276Q5ZPR3 534 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 COL21A1Q96P44 957 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 NFS1Q9Y697 457 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LAMB2P55268 1798 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 MASP2O00187 686 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND5O76080 213 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SCELO95171 688 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PTHP01270 115 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR3P46089 330 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 MICAQ29983 383 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 STEAP4Q687X5 459 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LAPTM4BQ86VI4 370 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PKMYT1Q99640 499 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CDK2P24941 298 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 F2RP25116 425 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FASLGP48023 281 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A8P48029 635 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ATP4BP51164 291 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PLP1P60201 277 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HSD11B2P80365 405 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 NCMAPQ5T1S8 102 aa5.85□□□□□ -1.47
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