RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-215ENST00000546102 FGF22Q9HCT0 170 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 FGF21Q9NSA1 209 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 BTRCQ9Y297 605 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 VCANP13611 3396 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.1□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 MUC3AQ02505 3323 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 BRWD1Q9NSI6 2320 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 SHISA7A6NL88 538 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 E7EQ34 232 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 H0YIV9 168 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 MYO1DO94832 1006 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 STAMBPO95630 424 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 PMS2P2O95744 297 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 TNFP01375 233 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 IGHV4-34P06331 123 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 YES1P07947 543 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ERGP11308 486 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 CDH1P12830 882 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 COX4I1P13073 169 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ZNF23P17027 643 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 SHMT2P34897 504 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 FOXA1P55317 472 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 CEACAM7Q14002 265 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 ZNF425Q6IV72 752 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 MED27Q6P2C8 311 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 Q6ZSR6 202 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 C17orf64Q86WR6 236 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.09□□□□□ -1.91
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CUL3-215ENST00000546102 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 LCN9Q8WX39 176 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 CLDN23Q96B33 292 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 ROPN1LQ96C74 230 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 BIRC7Q96CA5 298 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 RCN3Q96D15 328 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 MOCOSQ96EN8 888 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 LRR1Q96L50 414 aa3.09□□□□□ -1.91
CUL3-215ENST00000546102 RAB40CQ96S21 281 aa3.09□□□□□ -1.91
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