RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 FADS6Q8N9I5 356 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 DEFB118Q96PH6 123 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RBP7Q96R05 134 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TP53RKQ96S44 253 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SORT1Q99523 831 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TBX5Q99593 518 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ARHGDIGQ99819 225 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RNF122Q9H9V4 155 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 A0A1W2PPC4 97 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OOEPA6NGQ2 149 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 AQP7P3A6NL99 342 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 DLGAP1O14490 977 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 AQP7O14520 342 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 FZD7O75084 574 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 PSMB5P28074 263 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 GATA4P43694 442 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RGS4P49798 205 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TUBB3Q13509 450 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 GJD3Q8N144 294 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TMEM156Q8N614 296 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TCTN2Q96GX1 697 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TGM7Q96PF1 710 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 PEBP4Q96S96 227 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CHST5Q9GZS9 411 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 MED28Q9H204 178 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ARMCX1Q9P291 453 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 A0A1W2PQH9 124 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RNF212BA8MTL3 300 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 M0QXV9 152 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 WDR1O75083 606 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RAD51DO75771 328 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ATP6AP2O75787 350 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 GABARAPO95166 117 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 FGF19O95750 216 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 MT-ND4LP03901 98 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CEACAM5P06731 702 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ETFAP13804 333 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 PAX1P15863 534 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 LIPAP38571 399 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CD96P40200 585 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SLC37A1P57057 533 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SLC6A3Q01959 620 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 PIGGQ5H8A4 983 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 GLYATQ6IB77 296 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 TMEM205Q6UW68 189 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OR52E6Q96RD3 313 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ADI1Q9BV57 179 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 STRADBQ9C0K7 418 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 LHPPQ9H008 270 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 C1orf198Q9H425 327 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 MSL2Q9HCI7 577 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 SGK494L7N484 410 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 FABP7O15540 132 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 XRCC2O43543 280 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ACTL6BO94805 426 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 RCBTB2O95199 551 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 WNT11O96014 354 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CST4P01036 141 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 HOXB5P09067 269 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 OR4Q2P0C623 313 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 ARSBP15848 533 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 CD22P20273 847 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-225ENST00000541295 HOXA5P20719 270 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms