RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HPRP00739 348 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 UQCRC1P31930 480 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NTF4P34130 210 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TFF3Q07654 80 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OAFQ86UD1 273 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 STK32CQ86UX6 486 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 C12orf49Q9H741 205 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 VNN3Q9NY84 501 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CDC42EP2O14613 210 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CLOCKO15516 846 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CCNB2O95067 398 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FCGR1AP12314 374 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 AHCYP23526 432 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 AQP2P41181 271 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR4P46093 362 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 IL1RL1Q01638 556 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 MICAQ29983 383 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 BEND4Q6ZU67 534 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 AAED1Q7RTV5 226 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 LUZP2Q86TE4 346 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 APH1AQ96BI3 265 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 RCE1Q9Y256 329 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 C11orf98E9PRG8 122 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF13O43567 381 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PTP4A3O75365 173 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 TIPRLO75663 272 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CLDN1O95832 211 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 HLA-DOBP13765 273 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FPR3P25089 353 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FASP25445 335 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACSIN3-210ENST00000533686 CLDN17P56750 224 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PRPS1P60891 318 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FHL1Q13642 323 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 LAPTM4AQ15012 233 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP6AP1Q15904 470 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZBED5Q49AG3 693 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CASP12Q6UXS9 341 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 GPA33Q99795 319 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 U3KQV3 271 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 UNC119BA6NIH7 251 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF432O94892 652 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN31Q12999 210 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ALG10Q5BKT4 473 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 Q6ZT83 130 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 OR51A7Q8NH64 312 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 NRBF2Q96F24 287 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 NTN4Q9HB63 628 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 INIPQ9NRY2 104 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PRG6 482 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 E2F6O75461 281 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 GASTP01350 101 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 EDNRAP25101 427 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 CD79BP40259 229 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PEX19P40855 299 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 SELENOPP49908 381 aa14.55□□□□□ -0.08
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