RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 MS4A18H0YCH9 400 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SULT2B1O00204 365 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 AKR7A3O95154 331 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PMS2P2O95744 297 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 IGHMP01871 453 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 HPNP05981 417 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DIO1P49895 249 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC35A1P78382 337 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TMED1Q13445 227 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 KLHL12Q53G59 568 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 LEG1Q6P5S2 330 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 FAR1Q8WVX9 515 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 LGALS12Q96DT0 336 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 KLHL15Q96M94 604 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SPTBN2O15020 2390 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 A0A1W2PNV4 684 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 A0A1W2PRG6 482 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 LINC01387J3KSC0 135 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RAB36O95755 333 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC2A5P22732 501 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ACKR1Q16570 336 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 MESTQ5EB52 335 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GPR141Q7Z602 305 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 MUL1Q969V5 352 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DDOQ99489 341 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 FANCFQ9NPI8 374 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DKK4Q9UBT3 224 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 OR6C68A6NDL8 312 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 FAM166BA8MTA8 275 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 XKRYO14609 159 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 MAGEA5P43359 124 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC16A1P53985 500 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 LGALS3BPQ08380 585 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 IRF3Q14653 427 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RAB39AQ14964 217 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PXKQ7Z7A4 578 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ADCK1Q86TW2 530 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GHDCQ8N2G8 530 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 KDM8Q8N371 416 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TMEM99Q8N816 258 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RORBQ92753 470 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 A0A0J9YW62 118 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CCDC182A6NF36 153 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GYPBP06028 91 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ADRA2AP08913 450 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CLUP10909 449 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DCKP27707 260 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TTKP33981 857 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ACVR1BP36896 505 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 GFRA1P56159 465 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZNF519Q8TB69 540 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6 ms