RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 PLAURQ03405 335 aa9.96□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.96□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.96□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ATG16L1Q676U5 607 aa9.96□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.96□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 ZBTB18Q99592 522 aa9.96□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 RNF220Q5VTB9 566 aa9.95□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.95□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 SYT3Q9BQG1 590 aa9.95□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.95□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 NANPQ8TBE9 248 aa9.94□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 OR52E6Q96RD3 313 aa9.94□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 IFT52Q9Y366 437 aa9.94□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 J3QLI3 93 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 M0R3G1 203 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 RFXANKO14593 260 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 KCNAB3O43448 404 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 NPIPB7O75200 414 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 SEC14L2O76054 403 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 UBL3O95164 117 aa9.93□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 COL8A2P25067 703 aa9.93□□□□□ -0.82
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CMTM1-211ENST00000528484 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ARFIP2P53365 341 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 FOXL1Q12952 345 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 CAMK2DQ13557 499 aa9.93□□□□□ -0.82
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