RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP9Q99996 3911 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SH3D21A4FU49 640 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CASKO14936 926 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RCBTB2O95199 551 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ADAP00813 363 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GASTP01350 101 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FOSL1P15407 271 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IL11P20809 199 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SFTPDP35247 375 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OMPP47874 163 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EGR4Q05215 589 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 COX10Q12887 443 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LAPTM4AQ15012 233 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SNCBQ16143 134 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PGBD2Q6P3X8 592 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 P3H2Q8IVL5 708 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PFN4Q8NHR9 129 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SMPDL3BQ92485 455 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 WNT2BQ93097 391 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL15Q96M94 604 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR5B2Q96R09 309 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FEVQ99581 238 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR11A1Q9GZK7 315 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TIGARQ9NQ88 270 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DLL4Q9NR61 685 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PDLIM1O00151 329 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SULT2B1O00204 365 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PIP5K1CO60331 668 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR7A10O76100 309 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GOSR1O95249 250 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PMS2P2O95744 297 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CH25HO95992 272 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OPN1LWP04000 364 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HRGP04196 525 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FUT1P19526 365 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PTNP21246 168 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FPR3P25089 353 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SLC9A3P48764 834 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CARD18P57730 90 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35A1P78382 337 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN31Q12999 210 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DAG1Q14118 895 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF74Q16587 644 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LPCAT4Q643R3 524 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FAHD1Q6P587 224 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CBR4Q8N4T8 237 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR9Q2Q8NGE9 314 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LIPHQ8WWY8 451 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TAAR8Q969N4 342 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ARL5BQ96KC2 179 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DACH2Q96NX9 599 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ASPNQ9BXN1 380 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PIGMQ9H3S5 423 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FKRPQ9H9S5 495 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NANSQ9NR45 359 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf141Q9NUB4 165 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms