RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 SPOCK1Q08629 439 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 UGCGQ16739 394 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 UNC50Q53HI1 259 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.7□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 IL17CQ9P0M4 197 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 FLT4P35916 1363 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 OR2M5A3KFT3 312 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 SDC1P18827 310 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 TIMP3P35625 211 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DCTP40126 519 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MMP15P51511 669 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RIPPLY3P57055 190 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 PAX5Q02548 391 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 ZNF738Q8NE65 137 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RAB22AQ9UL26 194 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BTRCQ9Y297 605 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 UTRNP46939 3433 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DLX3O60479 287 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 B4GALT2O60909 372 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A12O75746 678 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MMP23AO75900 390 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SCGB1D1O95968 90 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CH25HO95992 272 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 AKT2P31751 481 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 RAB1AP62820 205 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CRMP1Q14194 572 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BATFQ16520 125 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 FBLN7Q53RD9 439 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DCST1Q5T197 706 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ISOC2Q96AB3 205 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 VOPP1Q96AW1 172 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC58Q96CX6 371 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.69□□□□□ -1.5
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