RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 IFI6P09912 130 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TFPTP0C1Z6 253 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 NR2F1P10589 423 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 IL11P20809 199 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TBXA2RP21731 343 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 DPP4P27487 766 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CCR4P51679 360 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MTPNP58546 118 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 DSTNP60981 165 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF117Q03924 483 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 PMPCAQ10713 525 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RGNQ15493 299 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MIDNQ504T8 468 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 GHDCQ8N2G8 530 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RNF138Q8WVD3 245 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 EXD2Q9NVH0 621 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 DKKL1Q9UK85 242 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TTC36A6NLP5 189 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 AIM2O14862 343 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SNX3O60493 162 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZG16O60844 167 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 STX11O75558 287 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CBR3O75828 277 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 NUDT14O95848 222 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 IGHG3P01860 377 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 HPNP05981 417 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 KRT16P08779 473 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 AQP1P29972 269 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RYKP34925 604 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ATP12AP54707 1039 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SNTA1Q13424 505 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MMEL1Q495T6 779 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 KLHL26Q53HC5 615 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RAET1LQ5VY80 246 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 REP15Q6BDI9 236 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RTL6Q6ICC9 239 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RNF144BQ7Z419 303 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 VRK2Q86Y07 508 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 FADS6Q8N9I5 356 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SMPDL3BQ92485 455 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RCN3Q96D15 328 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM19Q96HH6 336 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 UPB1Q9UBR1 384 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 WDR45Q9Y484 360 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-204ENST00000504431 TENM4Q6N022 2769 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms