RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 APH1AQ96BI3 265 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 GP6Q9HCN6 339 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 DOCK7Q96N67 2140 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 MPDZO75970 2070 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF716A6NP11 495 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF724A8MTY0 619 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 PLPP3O14495 311 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 TIPRLO75663 272 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 CCNB2O95067 398 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-9P01782 118 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEA2P43356 314 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 ASCL1P50553 236 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKCDQ05655 676 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC17A1Q14916 467 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 LAPTM4AQ15012 233 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC23BQ15437 767 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 AAED1Q7RTV5 226 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 OAFQ86UD1 273 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51A7Q8NH64 312 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 STARD4Q96DR4 205 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 OXGR1Q96P68 337 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 BCO1Q9HAY6 547 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MCIDASD6RGH6 385 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MAKP20794 623 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC16A1P53985 500 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CLDN17P56750 224 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 PDK3Q15120 406 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CARD17Q5XLA6 110 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 NIPAL3Q6P499 406 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 STMN2Q93045 179 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 FANCFQ9NPI8 374 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 UPB1Q9UBR1 384 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 AP4S1Q9Y587 144 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MED12LQ86YW9 2145 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PRG6 482 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC119BA6NIH7 251 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF726A6NNF4 738 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MSTNO14793 375 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 HPRP00739 348 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 F13BP05160 661 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 POU2F1P14859 743 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 AQP2P41181 271 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGDIAP52565 204 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTR3P61158 418 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 GUSBP1Q15486 140 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 INIPQ9NRY2 104 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 GALNT8Q9NY28 637 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A18H0YCH9 400 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CLOCKO15516 846 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IGF2P01344 180 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CD8BP10966 210 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 FCGR1AP12314 374 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-DOBP13765 273 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNGR1P15260 489 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 FASP25445 335 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC9A3P48764 834 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 P2RY4P51582 365 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 IST1P53990 364 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 ALG10Q5BKT4 473 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms