RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TIMM22Q9Y584 194 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CLDN25C9JDP6 229 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CRCPO75575 148 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MT-ND5P03915 603 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 LAMP1P11279 417 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PRKAR1BP31321 381 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FNDC8Q8TC99 324 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf82Q8WW14 230 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 LIPHQ8WWY8 451 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EGLN2Q96KS0 407 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 KCNA7Q96RP8 456 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR51I1Q9H343 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EQTNQ9NQ60 294 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf47O95873 294 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINA5P05154 406 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ETS2P15036 469 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TACR3P29371 465 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CASQ1P31415 396 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 HBA1P69905 142 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PAX2Q02962 417 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PCLAFQ15004 111 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CFAP157Q5JU67 520 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CCNJQ5T5M9 372 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SYT9Q86SS6 491 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 DDIASQ8IXT1 998 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF563Q8TA94 476 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ITFG2Q969R8 447 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 COG8Q96MW5 612 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 BIRC5O15392 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 AHCYL1O43865 530 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT14O95848 222 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV2-70P01814 119 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NR2C1P13056 603 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RAD52P43351 418 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf54Q08AI8 447 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CDK5R2Q13319 367 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MAPK14Q16539 360 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 GSG1Q2KHT4 349 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 HFEQ30201 348 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf128Q5T292 105 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA21Q7Z572 469 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PXKQ7Z7A4 578 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PTOV1Q86YD1 416 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TREML1Q86YW5 311 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 GATSQ8NAP1 163 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR6X1Q8NH79 312 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 BBS10Q8TAM1 723 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 EPYCQ99645 322 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SRRM5B3KS81 715 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 M0QZ24 198 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 HMGN4O00479 90 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PLPP2O43688 288 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ADRA2AP08913 450 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SELENOVP59797 346 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TEX35Q5T0J7 233 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPICQ8N5J4 248 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NOX3Q9HBY0 568 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms