RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 UBDO15205 165 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF749O43361 778 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PRKAB2O43741 272 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMPRSS11DO60235 418 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PLIN3O60664 434 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C1RP00736 705 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 P04436 131 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 BCHEP06276 602 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 H2BFMP0C1H6 154 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FCER1AP12319 257 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CREB1P16220 341 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FBLN1P23142 703 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GDF1P27539 372 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SDC4P31431 198 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CYP2J2P51589 502 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PRR5P85299 388 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A2Q01362 244 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC18A2Q05940 514 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ASAH1Q13510 395 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PHKG1Q16816 387 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NOXA1Q86UR1 476 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM25Q86YD3 366 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LGI2Q8N0V4 545 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 POC1AQ8NBT0 407 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC15Q8TF66 581 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RPEQ96AT9 228 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A14Q96JA4 679 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ARV1Q9H2C2 271 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CPVLQ9H3G5 476 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CLMPQ9H6B4 373 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NT5DC2Q9H857 520 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 BIN3Q9NQY0 253 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 HHLA2Q9UM44 414 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IRAK3Q9Y616 596 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CEP152O94986 1710 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LRP5LA4QPB2 252 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC160A6NGH7 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CXCR6O00574 342 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KRT33AO76009 404 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RAB36O95755 333 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 THY1P04216 161 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINA2P20848 420 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC6A1P30531 599 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 HPCAL1P37235 193 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 VEGFCP49767 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RAB7AP51149 207 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MLLT10P55197 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN15P56746 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SNAP25P60880 206 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PUDPQ08623 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf61Q13536 156 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 APOFQ13790 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PSMD5Q16401 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 LY6KQ17RY6 165 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SAXO2Q658L1 398 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF774Q6NX45 483 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR4K15Q8NH41 348 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR51F2Q8NH61 342 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TESCQ96BS2 214 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TIMD4Q96H15 378 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IFT46Q9NQC8 304 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 BFARQ9NZS9 450 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms