RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494465.5

ATG4B-225, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 2,365 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-225ENST00000494465 ARL5BQ96KC2 179 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 KCTD7Q96MP8 289 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ALG12Q9BV10 488 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 COPS3Q9UNS2 423 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PLPP3O14495 311 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RNF13O43567 381 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TCN2P20062 427 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TGM4P49221 684 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR6S1Q8NH40 331 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 POC1BQ8TC44 478 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FRMD6Q96NE9 622 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 A0A075B6Q4 140 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 J3QLW9 94 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GABRPO00591 440 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR2T1O43869 369 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IGHEP01854 428 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CD63P08962 238 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 JMJD7P0C870 316 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF19P17023 458 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SDC2P34741 201 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MXD1Q05195 221 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR6V1Q8N148 313 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FADS6Q8N9I5 356 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 COQ7Q99807 217 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MED18Q9BUE0 208 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 INIPQ9NRY2 104 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 WDR70Q9NW82 654 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 DVL2O14641 736 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF208O43345 1280 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PLPP2O43688 288 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 HLA-DPB1P04440 258 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GAAP10253 952 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RORCP51449 518 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SPEM2Q0P670 501 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF511Q8NB15 262 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF519Q8TB69 540 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FNDC8Q8TC99 324 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NTNG2Q96CW9 530 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CDC6Q99741 560 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NUAK2Q9H093 628 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GALNT8Q9NY28 637 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MOKQ9UQ07 419 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CTDSP2O14595 271 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GALP22466 123 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IFITM3Q01628 133 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SNTA1Q13424 505 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ACKR1Q16570 336 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CDONQ4KMG0 1287 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OPN5Q6U736 354 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RPTNQ6XPR3 784 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TPK1Q9H3S4 243 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SHISA3A0PJX4 238 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TP53I11O14683 189 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MT-CO3P00414 261 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IGHMP01871 453 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IMPDH2P12268 514 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 AHCYP23526 432 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MLF1P58340 268 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 Q0VFX4 171 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TP53I3Q53FA7 332 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SYS1Q8N2H4 156 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PELI1Q96FA3 418 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms