RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SH3GL1Q99961 368 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 STARD10Q9Y365 291 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SMCO3A2RU48 225 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RNF13O43567 381 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MGRN1O60291 552 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT7LO94864 414 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf105O95561 183 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 KRT14P02533 472 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW4P57775 412 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC14Q49A88 953 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 GPR157Q5UAW9 335 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR9G1Q8NH87 305 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 DCUN1D4Q92564 292 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCD2Q92925 531 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM101Q96IK0 257 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MBOAT4Q96T53 435 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 EXD2Q9NVH0 621 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RLFQ13129 1914 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 A0A075B6Q4 140 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 A8MUA0 341 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C9JVG2 144 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FMO3P31513 532 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 LYZP61626 148 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FGF14Q92915 247 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 IL17CQ9P0M4 197 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB11A5LHX3 300 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CCL21O00585 134 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 EMC8O43402 210 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV2-5P01817 119 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 HPNP05981 417 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CCNCP24863 283 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CD1BP29016 333 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CYTH1Q15438 398 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NRF1Q16656 503 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RNF212Q495C1 297 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PNKDQ8N490 385 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR7G2Q8NG99 324 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SIAEQ9HAT2 523 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NEK6Q9HC98 313 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ICAM2P13598 275 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PRRX1P54821 245 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B15P54855 530 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PRPS1P60891 318 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CHP1Q99653 195 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CALYQ9NYX4 217 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FAM231BA6NCW3 169 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf77C9JDV5 145 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 DLGAP1O14490 977 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ACTL6AO96019 429 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 HPGDP15428 266 aa5.4□□□□□ -1.54
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