RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491037.1

GAPDHP22-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP22, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 P3H2Q8IVL5 708 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM123Q8N131 208 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NSL1Q96IY1 281 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MUS81Q96NY9 551 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 C1orf21Q9H246 121 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NANSQ9NR45 359 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 UPB1Q9UBR1 384 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MED31Q9Y3C7 131 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 SPG11Q96JI7 2443 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.5□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 A0A1W2PPR1 153 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 A0A1W2PRQ8 180 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 LRRN3E7EW58 273 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MS4A18H0YCH9 400 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 FFAR1O14842 300 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 KLF4O43474 513 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC43A1O75387 559 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CH25HO95992 272 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 HPRP00739 348 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 IGHV3-9P01782 118 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NCK1P16333 377 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RHCEP18577 417 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PTNP21246 168 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CLDN17P56750 224 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PMS2P3Q13401 168 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 DGCR6Q14129 220 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PPA1Q15181 289 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 STK11Q15831 433 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 GABRA6Q16445 453 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NIPAL3Q6P499 406 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RNF148Q8N7C7 305 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MUCL1Q96DR8 90 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 SGTBQ96EQ0 304 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 LRR1Q96L50 414 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 OR2M2Q96R28 347 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CDRT15Q96T59 188 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CIB4A0PJX0 185 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 B2RBV5 119 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CENPBD1B2RD01 187 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMCC2O75069 709 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RAD51DO75771 328 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 KRT33AO76009 404 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 OR7A10O76100 309 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 OR6A2O95222 327 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 RAF1P04049 648 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 HIST1H2ABP04908 130 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ADORA3P0DMS8 318 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 T-ENOLP0DO92 83 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 ITGA2P17301 1181 aa7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GAPDHP22-201ENST00000491037 CBLP22681 906 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms