RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 C5orf34Q96MH7 638 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.453e-6■■□□□ 14.5
HOXB3-210ENST00000489475 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PNR3 127 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 NME2P1O60361 137 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 APOL3O95236 402 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ADRA2AP08913 450 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 NME2P22392 152 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR2B6P58173 313 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ZP4Q12836 540 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 UBE2UQ5VVX9 321 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 LEG1Q6P5S2 330 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TEAD3Q99594 435 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TAS2R16Q9NYV7 291 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ERGIC3Q9Y282 383 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FZD7O75084 574 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 LCKP06239 509 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CLUP10909 449 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 PSMB9P28065 219 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GP2P55259 537 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FDCSPQ8NFU4 85 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CEPT1Q9Y6K0 416 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PRG6 482 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 AKR7A3O95154 331 aa24.09■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 MYL12AP19105 171 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC2A5P22732 501 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 LGALS3BPQ08380 585 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 RNLSQ5VYX0 342 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GHDCQ8N2G8 530 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC39A7Q92504 469 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 MIB2Q96AX9 1013 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 DDOQ99489 341 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR2B2Q9GZK3 357 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TXNIPQ9H3M7 391 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 AKAP13Q12802 2813 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR6C68A6NDL8 312 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GJE1A6NN92 205 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 MS4A18H0YCH9 400 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SULT2B1O00204 365 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 EFSO43281 561 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC34A2O95436 690 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 PTHP01270 115 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GYPBP06028 91 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 DIO1P49895 249 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 B3GALT5-AS1P59052 145 aa24.08■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SMPDL3BQ92485 455 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 WASF3Q9UPY6 502 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC182A6NF36 153 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 XKRYO14609 159 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35A1P78382 337 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 MESTQ5EB52 335 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 B3GLCTQ6Y288 498 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 SHFQ7M4L6 423 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 OR4F15Q8NGB8 312 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 OR51G2Q8NGK0 314 aa24.07■■□□□ 1.44
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HOXB3-210ENST00000489475 SFXN2Q96NB2 322 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 KCNMB2Q9Y691 235 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 PMS2P2O95744 297 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 IGHMP01871 453 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 GPR107Q5VW38 600 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 ADCK1Q86TW2 530 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 KDM8Q8N371 416 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 CLEC2DQ9UHP7 191 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 RENP00797 406 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 PLGLB1Q02325 96 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM99Q8N816 258 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-210ENST00000489475 MND1Q9BWT6 205 aa24.06■■□□□ 1.44
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