RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 CHRNB3Q05901 458 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 FHL1Q13642 323 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 P2RY6Q15077 328 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 NRMQ8IXM6 262 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 APH1AQ96BI3 265 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 BOD1Q96IK1 185 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.66□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 DIRAS1O95057 198 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF43P17038 809 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 OMPP47874 163 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 PMS2P3Q13401 168 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 SEC23BQ15437 767 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 GPAT4Q86UL3 456 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 SEPHS2Q99611 448 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 C12orf49Q9H741 205 aa14.65□□□□□ -0.06
HCLS1-208ENST00000487290 ABCA4P78363 2273 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 GADD45GO95257 159 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 IFI30P13284 250 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 POU2F1P14859 743 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 FUT1P19526 365 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 MAKP20794 623 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 RRM2P31350 389 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 UGT2B10P36537 528 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 SPIBQ01892 262 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 UEVLDQ8IX04 471 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM123Q8N131 208 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.64□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CENPBD1B2RD01 187 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 GOSR1O95249 250 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 IGHMP01871 453 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ADORA3P0DMS8 318 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 HLA-DOBP13765 273 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 PPP3CBP16298 524 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CBLP22681 906 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 FAM27E3Q08E93 113 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CASP12Q6UXS9 341 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 AAED1Q7RTV5 226 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 KDM8Q8N371 416 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 LINC00471Q8N535 108 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 OR2T29Q8NH02 315 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 LRR1Q96L50 414 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CHID1Q9BWS9 393 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 PRSS50Q9UI38 385 aa14.63□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 C16orf97H3BN30 126 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 CDC42EP2O14613 210 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 HIST1H2ABP04908 130 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 SELENOPP49908 381 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ITGADQ13349 1161 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 TAF11Q15544 211 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 STK11Q15831 433 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 FGD3Q5JSP0 725 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 OR6X1Q8NH79 312 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-208ENST00000487290 FAM222BQ8WU58 562 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms