RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TFPIP10646 304 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF3P17036 446 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MAKP20794 623 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NME2P22392 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TNFSF10P50591 281 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NR1H2P55055 460 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAC3P60763 192 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAP1BP61224 184 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAP1AP62834 184 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 EFNB1P98172 346 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PLGLB1Q02325 96 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PLAURQ03405 335 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MVKQ03426 396 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 POU4F2Q12837 409 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 INAQ16352 499 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SGCBQ16585 318 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ALG10Q5BKT4 473 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF766Q5HY98 468 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RNLSQ5VYX0 342 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PXKQ7Z7A4 578 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GID4Q8IVV7 300 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF786Q8N393 782 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR2M7Q8NG81 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM163Q8TC26 289 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TAAR8Q969N4 342 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SCMH1Q96GD3 660 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SAMD8Q96LT4 415 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GNRHR2Q96P88 292 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 IFT27Q9BW83 186 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 UBQLN3Q9H347 655 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PROK2Q9HC23 129 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CMC2Q9NRP2 79 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MOKQ9UQ07 419 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RASD1Q9Y272 281 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MED13LQ71F56 2210 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1W2PRG6 482 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM72A0PK05 275 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CLCA1A8K7I4 914 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SULT2B1O00204 365 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PLPP3O14495 311 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 BHLHE40O14503 412 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 XKRYO14609 159 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ADAM10O14672 748 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PRODHO43272 600 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OIP5O43482 229 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZG16O60844 167 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CLPTM1O96005 669 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 EDN3P14138 238 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CRHBPP24387 322 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ACVR2AP27037 513 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GPR4P46093 362 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CARD18P57730 90 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 EGR4Q05215 589 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CD47Q08722 323 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FOXO1Q12778 655 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAB40BQ12829 278 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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