RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF128Q8TEB7 428 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT2BQ93097 391 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMD8Q96LT4 415 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIB1Q96RU8 372 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TM9SF2Q99805 663 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT27Q9BW83 186 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TOR3AQ9H497 397 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF122Q9H9V4 155 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GP6Q9HCN6 339 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 EMC3Q9P0I2 261 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPR1Q14643 2758 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF724A8MTY0 619 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MCIDASD6RGH6 385 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IMPA2O14732 288 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ARPC3O15145 178 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SNAP29O95721 258 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL10O95999 233 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGN1P05114 100 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 F13BP05160 661 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 NOS3P29474 1203 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GIPRP48546 466 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 FXYD6P3P58550 94 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK5Q00535 292 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GINS1Q14691 196 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 EMC4Q5J8M3 183 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM8Q8N371 416 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 LNX2Q8N448 690 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF570Q96NI8 536 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF3C1Q12789 2109 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NIZ1 184 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF726A6NNF4 738 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF716A6NP11 495 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZAR1LA6NP61 321 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 B8ZZF3 427 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YAE9 185 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 DLGAP1O14490 977 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 BHLHE40O14503 412 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC16A6O15403 523 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNHIT1O43257 154 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 RAMP1O60894 148 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINI2O75830 405 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 AQP8O94778 261 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R3DO95685 299 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNDC12O95881 172 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TGM6O95932 706 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNGP01579 166 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHMP01871 453 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 YES1P07947 543 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNGR1P15260 489 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK2P20151 261 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 SDHAP31040 664 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GRK5P34947 590 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMP3P35625 211 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPGP40121 348 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 AQP4P55087 323 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-208ENST00000462602 PER3P56645 1201 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms