RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DAPL1A0PJW8 107 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FUOMA2VDF0 154 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A8MVM7 634 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD5O60279 629 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SELENOFO60613 162 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UPK3AO75631 287 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CFIP05156 583 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HEXBP07686 556 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FREM3P0C091 2139 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COX6A1P12074 109 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GP1BBP13224 206 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCL4P13236 92 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CELP19835 753 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PGCP20142 388 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IL12BP29460 328 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PTGS2P35354 604 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SOX6P35712 828 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MTNR1BP49286 362 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 P2RY4P51582 365 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NRG3P56975 720 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FBXW4P57775 412 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR12D2P58182 307 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R43P59537 309 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZP4Q12836 540 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDK5R1Q15078 307 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRAM1Q15629 374 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NTRK2Q16620 822 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC58Q4VC31 144 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ALG10Q5BKT4 473 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CEP78Q5JTW2 689 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FDX2Q6P4F2 183 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf87Q6PH81 154 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDC20BQ86Y33 519 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FADS6Q8N9I5 356 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 POC1BQ8TC44 478 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM203Q969S6 136 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ITPKCQ96DU7 683 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RNF31Q96EP0 1072 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LOXL4Q96JB6 756 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf36Q96KX1 117 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NEURL2Q9BR09 285 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NUAK2Q9H093 628 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SP140LQ9H930 580 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NANSQ9NR45 359 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MYOTQ9UBF9 498 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MOKQ9UQ07 419 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0C4DFX4 3053 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms