RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MALT1Q9UDY8 824 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CD300AQ9UGN4 299 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 RASD1Q9Y272 281 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ACANP16112 2415 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5H1A6NKK0 313 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SHISA9B4DS77 424 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf98E9PRG8 122 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GOSR1O95249 250 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CH25HO95992 272 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 RAF1P04049 648 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 T-ENOLP0DO92 83 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP3CBP16298 524 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDX6P30041 224 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NCALDP61601 193 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOWP63302 87 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA1BP68363 451 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA4AP68366 448 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 BSPH1Q075Z2 132 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY6Q15077 328 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ACKR1Q16570 336 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF74Q16587 644 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 BEX5Q5H9J7 111 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 DEF8Q6ZN54 512 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA1AQ71U36 451 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM123Q8N131 208 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 FITM2Q8N6M3 262 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6S1Q8NH40 331 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B8Q92506 261 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 TPD52L3Q96J77 140 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB6Q9NWX5 421 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MED29Q9NX70 200 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC3Q9P0I2 261 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 UPB1Q9UBR1 384 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LPE4 126 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPZ6 126 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CIB4A0PJX0 185 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35F4A4IF30 521 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD8AP01732 235 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN19P0C672 248 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF43P17038 809 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GGT1P19440 569 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MAKP20794 623 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 MPGP29372 298 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF83P51522 516 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM8P78325 824 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 RUNX1T1Q06455 604 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2P3Q13401 168 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK2DQ13557 499 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 FHL1Q13642 323 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MELKQ14680 651 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PPA1Q15181 289 aa6.13□□□□□ -1.43
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