RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZS92 163 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR7G2Q8NG99 324 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO30Q8TB52 745 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RND1Q92730 232 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOB3AQ96BX8 217 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR52B2Q96RD2 323 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASL10BQ96S79 203 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCT7Q99832 543 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REEP4Q9H6H4 257 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HHATLQ9HCP6 504 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSME2Q9UL46 239 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SVILO95425 2214 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF195O14628 629 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDAC3O15379 428 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNHIT1O43257 154 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFS7O75251 213 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOX30O94993 753 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP1B1P05026 303 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARSBP15848 533 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTSP30990 170 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSR4P51571 173 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN20P56880 219 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROK1P58294 105 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMX2Q04743 252 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THAP6Q8TBB0 222 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TM9SF4Q92544 642 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPCDCQ96CD2 204 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX37Q96LM6 180 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EBF4Q9BQW3 602 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHCGQ9UBD6 479 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL19Q9UHD0 177 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL12A1Q99715 3063 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF11O14901 512 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST8SIA3O43173 380 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SELENOFO60613 162 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C6orf47O95873 294 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QCP02747 245 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G2AP14555 144 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD1EP15812 388 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAGAP17050 411 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LBPP18428 481 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPX3P22352 226 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HPCAL1P37235 193 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTH2RP49190 550 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMDP50402 254 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FUT7Q11130 342 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE7AQ13946 482 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPTPQ5TA50 214 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FHL5Q5TD97 284 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZSV7 163 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT10Q86SR1 603 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD46Q86W74 232 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms