RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 HAS2Q92819 552 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 WBP2Q969T9 261 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ARSGQ96EG1 525 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SEC22AQ96IW7 307 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 OR5M11Q96RB7 305 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 D6RAR5 112 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SLC35E2P0CK97 266 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 HOXA9P31269 272 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 RAB3CQ96E17 227 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 GNG12Q9UBI6 72 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 PIGTQ969N2 578 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF225Q9UK10 706 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 RELAQ04206 551 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ILKQ13418 452 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SGPP1Q9BX95 441 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 WDR76Q9H967 626 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 PLPP1O14494 284 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SELENOFO60613 162 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 FRMD1Q8N878 549 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ELP4Q96EB1 424 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NEURL3Q96EH8 262 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PADI1Q9ULC6 663 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 NUP98P52948 1817 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 FAM166BA8MTA8 275 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ABHD4Q8TB40 342 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PIGQQ9BRB3 760 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.86■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.86■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.86■□□□□ 0.13
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PTPRF-209ENST00000438120 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 MOKQ9UQ07 419 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 CLDN24A6NM45 220 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-209ENST00000438120 A8MXE2 369 aa15.86■□□□□ 0.13
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