RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 APBB3O95704 486 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CFDP00746 253 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A25Q6KCM7 469 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LEG1Q6P5S2 330 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4C3Q8NH37 302 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MOSPD2Q8NHP6 518 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC22CQ9BRL7 303 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FBRSQ9HAH7 460 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HCN3Q9P1Z3 774 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 V9GY05 133 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WUJ7 227 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD5O14737 125 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LCN1P31025 176 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS15P62841 145 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ERV3-1Q14264 604 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR139Q6DWJ6 353 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T4Q8NH00 348 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNPRQ8TBG9 265 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 VSTM2LQ96N03 204 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DDOQ99489 341 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FKRPQ9H9S5 495 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 EML5Q05BV3 1969 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 B4DGG1 531 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GABARAPH6UMI1 98 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SHOXO15266 292 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNA7P01567 189 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PDGFAP04085 211 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CD1AP06126 327 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PUDPQ08623 228 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GATSQ8NAP1 163 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf216Q8TAB5 229 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC120Q96HB5 630 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 Q96M85 177 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG12Q9BV10 488 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 EVA1AQ9H8M9 152 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH15Q96QU1 1955 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC16AO15027 2179 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SDC3O75056 442 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FOSL2P15408 326 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD52P43351 418 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX2P48431 317 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SMUG1Q53HV7 270 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM69Q5SWH9 247 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF8Q7Z7C8 310 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A6Q8IZM9 456 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FCAMRQ8WWV6 532 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RBP7Q96R05 134 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DHRS9Q9BPW9 319 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 UBQLN2Q9UHD9 624 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF337Q9Y3M9 751 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP4O75096 1905 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 I3L1I5 382 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF250P15622 560 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN5P62079 268 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF141Q15928 474 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD7Q86VX2 200 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTM3Q96MX0 182 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NPTNQ9Y639 398 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC13CQ8NB66 2214 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BSH0 61 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF749O43361 778 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7A10O76100 309 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP2P41181 271 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PTH2RP49190 550 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35F3Q8IY50 421 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC20Q8TCA0 184 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXJ3Q9UPW0 622 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 AUP1Q9Y679 476 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP7Q9Y680 259 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms