RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 HPRP00739 348 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ADORA3P0DMS8 318 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 UMPSP11172 480 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 AHCYP23526 432 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MPGP29372 298 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SELENOPP49908 381 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 UGT2B15P54855 530 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAM2Q15035 370 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 STK11Q15831 433 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 BEX5Q5H9J7 111 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 OR7E24Q6IFN5 339 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RINLQ6ZS11 566 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PXKQ7Z7A4 578 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CDC20BQ86Y33 519 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PFN4Q8NHR9 129 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SGTBQ96EQ0 304 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C1orf21Q9H246 121 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 EDARQ9UNE0 448 aa15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 OR5H1A6NKK0 313 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 J3KTA2 159 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC43A1O75387 559 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RAD51DO75771 328 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 OR7A10O76100 309 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGA5P08648 1049 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 NR1H2P55055 460 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TAB1Q15750 504 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CDH24Q86UP0 819 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MUCL1Q96DR8 90 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PYURFQ96I23 114 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MUC13Q9H3R2 512 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.86■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FFAR1O14842 300 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SIAH2O43255 324 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF432O94892 652 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PRSS23O95084 383 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGA2P17301 1181 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RHCEP18577 417 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZP4Q12836 540 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PPA1Q15181 289 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 LIPHQ8WWY8 451 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MUS81Q96NY9 551 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 OR2M2Q96R28 347 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RHCGQ9UBD6 479 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 F8P00451 2351 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.85■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C11orf98E9PRG8 122 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 KLF4O43474 513 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RNF13O43567 381 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 UBOX5O94941 541 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 HLA-DOBP13765 273 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FUT1P19526 365 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 HOXC12P31275 282 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 GABRA6Q16445 453 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MTX3Q5HYI7 312 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM123Q8N131 208 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C7orf34Q96L11 122 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 V9GYQ6 96 aa15.84■□□□□ 0.13
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A1W2PRQ8 180 aa15.83■□□□□ 0.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF726A6NNF4 738 aa15.83■□□□□ 0.12
SEMA3B-201ENST00000416295 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.83■□□□□ 0.12
SEMA3B-201ENST00000416295 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.83■□□□□ 0.12
SEMA3B-201ENST00000416295 UPK3AO75631 287 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms