RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 CFPP27918 469 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CTXN1P60606 82 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 Q499Y3 187 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 Q7L0L9 218 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 KLHL15Q96M94 604 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 DERL3Q96Q80 235 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 NOX4Q9NPH5 578 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LANCL2Q9NS86 450 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 SELENOFO60613 162 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR2B3O76000 313 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 IGKV3-11P04433 115 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ANXA3P12429 323 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.511e-7■■■■□ 20.2
PRAME-203ENST00000402697 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 MADCAM1Q13477 382 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LUZP2Q86TE4 346 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CDC20BQ86Y33 519 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 SIAH3Q8IW03 269 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 DEFB119Q8N690 84 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR51J1Q9H342 316 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CUTCQ9NTM9 273 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 USP34Q70CQ2 3546 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 A0A0A6YYJ9 748 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR6C76A6NM76 312 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TMEM212A6NML5 194 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LMO7DNF2Z398 122 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GNB5O14775 395 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 AQP2P41181 271 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 CCR9P51686 369 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 HCCSP53701 268 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ERV3-1Q14264 604 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 FDX2Q6P4F2 183 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TIGD4Q8IY51 512 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LMX1AQ8TE12 382 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 HGDQ93099 445 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 RASD2Q96D21 266 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 RADILQ96JH8 1075 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 Q96M85 177 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 WDR76Q9H967 626 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 NUDT15Q9NV35 164 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 WNT1P04628 370 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 DPP4P27487 766 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 STARD6P59095 220 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GNG2P59768 71 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 LPAR4Q99677 370 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 BEX2Q9BXY8 128 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-203ENST00000402697 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms